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bit가 눈 앞에서 왔다갔다

리눅스 Screen 사용, 명령어

터미널이 종료돼도 명령어가 백그라운드에서 돌아가도록 하는 screen. 연구하다가 원격 프로그램 꺼지거나 갑자기 컴퓨터가 업데이트 되면 학습되던게 날아가서...ㅎ screen을 사용하게 되었다. (Centos) yum install screen (Unbuntu) apt-get install screen 으로 설치할 수 있다고 하는데, apt-get으로 하면 sudo 권한을 묻고, 나는 sudoer도 아니라서 설치도 안된다. 그래서 그냥 pip install screen 으로 받아줌 1. Screen 생성 # 이름 랜덤 생성 screen # 이름 지정해서 생성 screen -S [이름 또는 번호] 2. Screen 진입 # screen 리스트 출력 screen -ls # 이미 존재하는 스크린에 진입 scr..
연구 2024. 2. 19. 10:34
[서버관리] 리눅스 기본 쉘 설정

0_ 환경 Ubuntu 18.04.2 LTS 1_ 사용할 수 있는 쉘 확인 cat /etc/shells # /etc/shells -> 해당 컴퓨터에서 사용이 가능한 쉘들 chsh -l도 가능하다고 들었는데 (change shell) 내 환경에선 안먹혔다. 2_ chsh -s을 활용해 기본쉘 설정 chsh -s /bin/bash password를 입력하고 터미널을 다시 켜면 바뀌어있다 3. .bashrc 작용 안됐을 때 # source 명령어로 .bashrc 적용 source ~/.bashrc # .bash_profile 만들어서 자동 적용 echo "source ~/.bashrc" > ~/.bash_profile
연구 2023. 6. 30. 15:19
알아두기) vcf파일 chr+숫자 position 맞게 정렬

https://korbillgates.tistory.com/226 [생물정보학] vcf 파일 chromosome, position 별로 정렬 sorting 하기 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 vcf 파일을 chromosome 별로 position 별로 정렬 sorting 하는 방법에 대해 알아보겠습니다. 들어가며 가끔 vcf 파일이 다음과 같이 sorting 되어있지 않는 경우가 있는데 korbillgates.tistory.com 알아두면 좋을거 같아서 저장,,, 최고다 진짜...
연구 2023. 6. 29. 11:40
서버 관리자가 되었다.

박사 선배님 한 분이 졸업하시면서 관리하시던 서버를 인수인계 받았다. 교수님이 갑자기 부르셔서 무슨 일이지,,하고 뛰어갔는데 (아직까지 신입생을 전화로 부르신적은 없음) 서버 하나 관리하라고 하셨다. GPU가 엄청 좋은건 아니지만 쓰는 사람도 별로 없고 막 쓸 수 있는거라고 본체도 보고 패스워드도 받아가라 하심. 일 생긴건데(?) 신난다. 나도 sudo 찍을 수 있다. su 찍고 패스워드 찍으면 root된다.
대학원 일기 2023. 6. 26. 17:54
나의 Matrix Factorization 이야기 (2)

교수님께서 결과 나온 matrix 직접 확인해 봤냐고 물어보셨다. drug마다 어떤 건 response가 높을 거고 어떤 건 낮을 테니, drug마다의 상관관계를 봐야 한다고 하셨다. 내 결과를 보고 언니가 보고 충격받아서 drug간의 correlation을 엄청 오래 따져봤었다는 다른 박사과정 선배님한테 찾아가셔서 꽤 오랜 토론을 하셨다. 그 와중에 신입생은 들을수록 새로웠다. - cell line에 비해 drug는 잘 안나오는게 당연 - 그리고 더 많은 이야기를 하셨는데, 월요일에 정확히 한번 더 물어봐야겠다. 1. column마다 correlation 구하기 가능한 경우들을 대부분 시도해봤다. 다들 고만고만하게 괜찮게 나왔는데 prediction에 대한 것만 상관계수들이 Nan 값이 찍히면서 hea..
연구 2023. 4. 21. 21:36
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